Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NischQ80TM9 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NischQ80TM9 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
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