Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
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Clec18aQ7TSQ1 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Clec18aQ7TSQ1 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Clec18aQ7TSQ1 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Clec18aQ7TSQ1 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Clec18aQ7TSQ1 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Clec18aQ7TSQ1 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Clec18aQ7TSQ1 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Clec18aQ7TSQ1 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Clec18aQ7TSQ1 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Clec18aQ7TSQ1 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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Clec18aQ7TSQ1 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Clec18aQ7TSQ1 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Clec18aQ7TSQ1 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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