Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms