Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prrc2bQ7TPM1 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prrc2bQ7TPM1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms