Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shq1Q7TMX5 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms