Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Eci3Q78JN3 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms