Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
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Nme8Q715T0 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Nme8Q715T0 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Nme8Q715T0 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Nme8Q715T0 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
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Nme8Q715T0 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Nme8Q715T0 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Nme8Q715T0 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Nme8Q715T0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Nme8Q715T0 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Nme8Q715T0 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Nme8Q715T0 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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Nme8Q715T0 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nme8Q715T0 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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