Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
LcorQ6ZPI3 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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