Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ccdc88cQ6VGS5 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ccdc88cQ6VGS5 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ccdc88cQ6VGS5 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc88cQ6VGS5 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ccdc88cQ6VGS5 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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