Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atp8b3Q6UQ17 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Atp8b3Q6UQ17 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Atp8b3Q6UQ17 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Atp8b3Q6UQ17 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Atp8b3Q6UQ17 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8b3Q6UQ17 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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