Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFD9

Nup98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup98Q6PFD9 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nup98Q6PFD9 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms