Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trak1Q6PD31 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms