Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Zbtb40Q6PCS8 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Zbtb40Q6PCS8 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zbtb40Q6PCS8 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms