Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Smchd1Q6P5D8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smchd1Q6P5D8 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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