Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
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CltbQ6IRU5 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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CltbQ6IRU5 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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CltbQ6IRU5 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CltbQ6IRU5 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms