Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scaf8Q6DID3 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms