Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smarca2Q6DIC0 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms