Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFZ1

Gbf1, Golgi-specific brefeldin A-resistance factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbf1Q6DFZ1 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gbf1Q6DFZ1 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gbf1Q6DFZ1 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms