Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 1,026 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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Lrrcc1Q69ZB0 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Lrrcc1Q69ZB0 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Lrrcc1Q69ZB0 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Lrrcc1Q69ZB0 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lrrcc1Q69ZB0 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lrrcc1Q69ZB0 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms