Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CltcQ68FD5 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CltcQ68FD5 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms