Protein–RNA interactions for Protein: Q66X22

Nlrp9b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9bQ66X22 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nlrp9bQ66X22 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp9bQ66X22 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp9bQ66X22 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp9bQ66X22 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp9bQ66X22 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp9bQ66X22 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp9bQ66X22 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp9bQ66X22 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp9bQ66X22 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp9bQ66X22 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp9bQ66X22 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp9bQ66X22 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp9bQ66X22 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp9bQ66X22 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp9bQ66X22 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp9bQ66X22 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp9bQ66X22 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp9bQ66X22 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp9bQ66X22 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp9bQ66X22 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp9bQ66X22 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp9bQ66X22 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp9bQ66X22 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp9bQ66X22 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp9bQ66X22 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp9bQ66X22 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp9bQ66X22 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp9bQ66X22 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp9bQ66X22 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp9bQ66X22 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp9bQ66X22 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp9bQ66X22 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp9bQ66X22 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp9bQ66X22 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp9bQ66X22 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nlrp9bQ66X22 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nlrp9bQ66X22 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms