Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Top2bQ64511 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Top2bQ64511 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms