Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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PtprdQ64487 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
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PtprdQ64487 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PtprdQ64487 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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