Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Irf4Q64287 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Irf4Q64287 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Irf4Q64287 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Irf4Q64287 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Irf4Q64287 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Irf4Q64287 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms