Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Defa17Q64016 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Defa17Q64016 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms