Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm5dQ62240 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm5dQ62240 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm5dQ62240 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kdm5dQ62240 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Kdm5dQ62240 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
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