Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ecm1Q61508 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ecm1Q61508 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ecm1Q61508 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ecm1Q61508 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ecm1Q61508 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ecm1Q61508 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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