Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Msi1Q61474 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms