Protein–RNA interactions for Protein: Q61282

Acan, Aggrecan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcanQ61282 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AcanQ61282 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
AcanQ61282 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
AcanQ61282 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
AcanQ61282 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
AcanQ61282 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
AcanQ61282 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
AcanQ61282 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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