Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Klf3Q60980 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms