Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Utp18Q5SSI6 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms