Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Gm15968-201ENSMUST00000119342 1168 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Phf12Q5SPL2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Phf12Q5SPL2 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms