Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

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Length 500 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ccdc85aQ5SP85 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ccdc85aQ5SP85 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ccdc85aQ5SP85 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ccdc85aQ5SP85 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ccdc85aQ5SP85 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ccdc85aQ5SP85 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ccdc85aQ5SP85 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ccdc85aQ5SP85 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ccdc85aQ5SP85 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ccdc85aQ5SP85 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc85aQ5SP85 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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