Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpm3Q5F4S9 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trpm3Q5F4S9 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trpm3Q5F4S9 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Trpm3Q5F4S9 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trpm3Q5F4S9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms