Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZF3

Ddx49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddx49Q4FZF3 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx49Q4FZF3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx49Q4FZF3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx49Q4FZF3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx49Q4FZF3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Ddx49Q4FZF3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx49Q4FZF3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx49Q4FZF3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx49Q4FZF3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx49Q4FZF3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ddx49Q4FZF3 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ddx49Q4FZF3 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ddx49Q4FZF3 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ddx49Q4FZF3 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ddx49Q4FZF3 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ddx49Q4FZF3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ddx49Q4FZF3 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx49Q4FZF3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx49Q4FZF3 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ddx49Q4FZF3 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx49Q4FZF3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ddx49Q4FZF3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx49Q4FZF3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx49Q4FZF3 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx49Q4FZF3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx49Q4FZF3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx49Q4FZF3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx49Q4FZF3 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx49Q4FZF3 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx49Q4FZF3 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx49Q4FZF3 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx49Q4FZF3 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx49Q4FZF3 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx49Q4FZF3 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx49Q4FZF3 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx49Q4FZF3 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx49Q4FZF3 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx49Q4FZF3 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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