Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fchsd2Q3USJ8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms