Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5460Q3UQ97 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5460Q3UQ97 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5460Q3UQ97 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm5460Q3UQ97 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5460Q3UQ97 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5460Q3UQ97 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5460Q3UQ97 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5460Q3UQ97 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5460Q3UQ97 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5460Q3UQ97 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5460Q3UQ97 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5460Q3UQ97 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5460Q3UQ97 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5460Q3UQ97 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5460Q3UQ97 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5460Q3UQ97 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5460Q3UQ97 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm5460Q3UQ97 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5460Q3UQ97 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm5460Q3UQ97 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm5460Q3UQ97 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm5460Q3UQ97 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm5460Q3UQ97 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm5460Q3UQ97 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5460Q3UQ97 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm5460Q3UQ97 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm5460Q3UQ97 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Gm5460Q3UQ97 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5460Q3UQ97 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Gm5460Q3UQ97 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5460Q3UQ97 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Gm5460Q3UQ97 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5460Q3UQ97 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5460Q3UQ97 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5460Q3UQ97 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5460Q3UQ97 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5460Q3UQ97 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5460Q3UQ97 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5460Q3UQ97 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5460Q3UQ97 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5460Q3UQ97 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm5460Q3UQ97 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5460Q3UQ97 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5460Q3UQ97 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm5460Q3UQ97 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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