Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3UPC7 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3UPC7 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UPC7 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UPC7 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UPC7 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UPC7 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UPC7 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UPC7 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3UPC7 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms