Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms