Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gpr55Q3UJF0 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms