Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Nkx6-3Q3UHX8 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
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