Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHH1

Zswim8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,832 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zswim8Q3UHH1 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Zswim8Q3UHH1 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms