Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Otud5Q3U2S4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Otud5Q3U2S4 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms