Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Kdm4dQ3U2K5 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms