Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy4Q3TYX8 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy4Q3TYX8 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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