Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ctdnep1Q3TP92 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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