Protein–RNA interactions for Protein: Q3TAA7

Stk11ip, Serine/threonine-protein kinase 11-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,072 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk11ipQ3TAA7 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Stk11ipQ3TAA7 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms