Protein–RNA interactions for Protein: Q2MH31

Smrp1, Spermatid-specific manchette-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smrp1Q2MH31 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smrp1Q2MH31 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms