Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Traf3ip1Q149C2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf3ip1Q149C2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf3ip1Q149C2 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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