Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn2bQ0KL01 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn2bQ0KL01 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms